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漠南蒙古，即居住于大漠（戈壁沙漠）以南的蒙古族，其居住地域大概为今中国内蒙古自治区，历史上直至13世紀中葉仍為漢族聚居地^[1]，後來成为蒙古族聚居地。在理藩院則例中，此名一直在官書中使用，与漠北蒙古（喀尔喀蒙古）相对。

元朝末年农民起义，明朝建立，元朝残余势力退至长城以北，史称北元。北元后分裂成许多部落。察哈尔部为漠南蒙古中一支显赫的部落，末代蒙古大汗林丹汗即在此。

後金甫興起时，與察哈爾部交战，林丹汗兵败后逃亡，其子额哲于1635年向后金皇太极投降，并献出当年元朝末代皇帝元顺帝带走的传国玺。漠南蒙古遂被併入后金（后为清朝）版图。